１９５９－１９６１年，史称三年自然灾害时期。孝感地区 １９５９年特大干旱以后，１９６０年、１９６１年又连续干旱，造成全区三年减产粮食 ２０．５５亿公斤。三年中，外流乞讨 ６７　３９８人，非正常死亡 １７　３５１人。由于粮食奇缺，灾民营养不良，１９６０－１９６１年 “四病，，人数达到２５４　１６９人。其中，浮肿 １４　２０８人，干瘦５２　９４４人，子宫脱垂 ６４　５３６人，妇女闭经 １２２　４８１人。

１９５９年 ６月８日下午至 ９日上午，全区有 １０个县遭暴雨袭击。汉川、汉阳、应城、云梦、黄破、武昌等 ６县降雨量在２００毫米以上，孝感、大悟、应山、安陆等 ４县在 １００毫米左右。发生水灾时，有 ２８５５公顷小麦堆被冲走，倒塌房屋 １１９８间，毁坏塘堰、堤坝 １６　７３６处，死亡 １３人，伤３４人。后是旱灾。全区从７月到 ９月有 ８２天未下透墒雨。全年受灾人口３５３．２６万人，受灾面积 ３３．８８万公顷。其中，成灾人口１７３．２４万人，成灾面积 ２０．６１万公顷。全年减产粮食５４　２９６万公斤。

全区救灾措施：“复秋”小杂粮 １９．０７万公顷；种菜 １２．０１万公顷，收菜 １６．８亿公斤；采集藕、菱角、旅根等代食品２．５亿公斤；投人副业生产２０余万人，收人 １６　０２５万元。国家发放生活救济款４６１．９万元，生产贷款２８４２万元。另外，对因灾致病的浮肿病人进行救济和治疗。发放救济款 １５０多万元，免费治疗款 １５万元。给病人发放大米２３５万公斤，黄豆 ９７．５０万公斤，红糖 １１．２７万公斤，红枣 ６．２０万公斤，食油 ８．０２万公斤，猪肉３．６２公斤，牛肉 １．０５万公斤，面条５．３０万公斤，糕点 ８．０８万公斤。全区建立临时医院１１００个，组织医务人员 ５１３２人 ，治疗病人 ４．６８万人，当年治愈 １．５４万人。

３月下旬起，农民因生活问题大批外流。据专署救灾办公室统计，外流人数达到５．５３万人。其中，外流人口最多的孝感县 １．９８万人，黄破县 １．０８万人。为做好外流人员返乡工作，孝感专署成立 “清理外流农民办公室”，在黄破横店、孝感城关及花园镇、应山广水镇设立四个收容站。同时，派出 １２３名干部分赴河南、湖南、江西等地动员遗返外流农民返乡。当年遣返回乡的农民２．５０万人。全年非正常死亡 １．６０万人。弃婴８１４人，领回５７０人，被人领养５６人，死亡２６人，民政部门收养 １６２人。

１９６０年５月 １７日晚８时至次日凌晨 ４时，全区突遭暴风雨袭击，陆地风力 ８－９级，江湖水面达到 １０级，降雨量３０一８０毫米，造成严重灾害。据不完全统计，倒塌房屋９６９１栋，揭顶和部分倒塌 １２　２６３栋；沉船 １７４只，击坏船只 ６９只；因房倒、沉船死亡７４人，受伤７２３人；死亡耕牛５０头，生猪 ２６２头；损失捕鱼埂网９０３１条，毛箱９８０８个；水稻、棉花、杂粮、芋麻、果树也损失很大。６月 ２５日一２８日，应山、大悟、孝感、应城等县连降暴雨，雨量 ２００一４００毫米，造成山洪暴发，堤烷溃口。孝感县死亡 １４人，冲毁房屋４４２６间，冲走粮食 ５９３．５吨。该县朋兴区挂口等３处溃口，应城县天鹅挡围堰漫溃，垦区被淹。７月下旬一９月下旬，全区伏旱连秋旱。孝感县７月２１日一９月 ６日降雨量只 １８．１毫米。全年全区受灾面积 １８．３万公顷，成灾面积 １５．４５万公顷。“四病”病人合计 １９．１３万人。其中，浮肿５６１３人，干瘦 ３．６２万人，子宫脱垂３．２８万人，妇女闭经 １１．６７万人。

为了安排好灾民生活，全区共安排生活救济款６０８．９万元，下拨粮食２７　９９８万公斤。国家安排赊销米杂１０５０万公斤。据 ８县 （缺孝感、黄破、武昌、通山）统计，制发棉衣 ５．９５万件，棉被 １．３３床，解决 ３７万多人过冬问题。全年下拨 “四病”救济款和医疗营养补助款 ２１１万元。其中，湖北省拨 ５２万元，武汉市人民委员会拨款 １５９万元。下发的营养物资有：黄豆２４３　１９１公斤，红糖５６　７６３公斤，红枣 ２２　５６８公斤，肉类２５　９５６公斤，大米 ９１　８４６公斤，其他营养品４３　７７６公斤。全区外流农民１０　６１８人，收容弃婴 １３７人。全区有孤儿６９２９人，应集中收养 ４９６２人，年底收养 ３６４７人，收养单位有 ９４处。全年非正常死亡 １３３８人。

１９６１年孝感地区又遭受大旱，以应城、应山、黄破、孝感、安陆、大悟、武昌等县为最重。旱情时间长、损失大。１－９月降雨量只有 ６００－８００毫米，比常年减少４００　－　６００毫米。全区大小河流３８３条，有３４２条断流，应山、应城、黄破、孝感、大悟、安陆等 ９县共有 ３０万个塘堰，干涸 ２６．４万个，许多地区无水栽秧、保苗，人畜饮水困难。黄破县李集区１９２个村湾，人吃水凭票供应。全区水田４２．５３万公顷，有９．７３万公顷未插上秧；栽 ３２．６７万公顷，无收 ６．３３万公顷，欠收 １１．８万公顷。旱作物计划播种 ２１．８７万公顷，７．０７万公顷未种上；已种的 １４．８万公顷，无收 ２．５万公顷。全区 １９６１年粮食总产 １０８　９４５万公斤，比　１９５７年的２０３　５８５万公斤减少 ４６．１％。在 ５０７万农业人口中，重灾 ２１３万人，轻灾 １４０万人。

专署成立生产救灾委员会，专员樊作楷任主任委员。从上到下都建立救灾办公室，由书记挂帅，“五长”（县长、区长、社长、大队长、生产队长 ）负责。全区种自留地 ３．５３万公顷，开荒５．４万公顷，借地６．５３万公顷，合计 １５．４６万公顷。其中，种植杂粮红薯 ９．２万公顷，收获粮食 ９７１５万公斤。另外，还种植 ６．２７万公顷蔬菜，采集橡子、藕、曹藤等代食品８５００万公斤。

对重灾缺粮队的口粮安排，按每人每月７．５公斤粮食的标准，安排到 １９６２年麦收。口粮只有７．５公斤的，征购任务全免；口粮在 ７．５公斤以下的，国家供应到 ７．５公斤。全年发放救济款 ９６４．２万元，银行贷款 １８０８万元。其中，救灾专用 ８９９万元。国营商业系统下发大批救灾物资：铅钉 ３０００公斤，铁丝 ３０００公斤，食糖９５　０００公斤，食盐 １２２．６０万公斤，棉布２８．８０米，棉花 １６．３万公斤，各种药品 １４．１万元。荆州地区调给孝感地区代食品 （棉饼）１５０万公斤。

全区３．５万多个缺粮生产队，９０％的队粮食安排落实，还修房 ８．８万间，解决棉衣 １３．５万件，棉被２．２７多床，烧柴和牛草都进行安排。农村形势好转，病人下降，外流基本杜绝。全区 “四病”人数６．２９万人，比１９６０年的 １９．１３万人减少 １２．８４万人；外流 １４５８人，比 １９６０年的 １．０６万人减少 ９１６０人；弃婴 ２６人，比１９６０年 １３７人减少 １１１人；非正常死亡７人。