２００４年，全市注册科研机构５６家。其中民办２４家。科普协会、学会和专业研究会 ３６０个。企业技术开发机构 ３８３个，占企业总数的７９％。几个重点科研机构介绍如下：

一、孝感市应用技术研究所

１９７２年组建，原名孝感地区微生物站。全民事业单位，市科技局直属二级单位，实验场地在孝感城区城站路针织厂院内。１９７８年更名为 “孝感地区微生物研究所”。１９８２年迁至市科技局院内。１９９３年更名为“孝感市应用技术研究所”。１９７２－１９７７年主要进行农用菌肥、菌药的试验研究，主要项目是 “５４０６菌肥”、＂７２１６菌药”、“赤霉素”。１９７８－１９８０年主要进行 《分离筛选防治红岭虫新菌株》的攻关、试验、示范。１９８１－２００５年主要从事食用菌的研究工作。实施项目有 （（地下人防室人工栽培天麻》、《杂木屑生料栽培香菇试验》。申报省级科研课题并获得批准实施的有 《高产灵芝菌株选育及系列产品开发》项 目等。主要攻关项目有 《袋栽香菇新技术研究》等。二、孝感市农业科学研究所

市农业局二级单位。１９４９年 １０月初创，原名孝感专署横店农业试验场，１９５１年迁址到孝感城关北门陈家岔路 （现董永公园）。１９５７年 ７月，经省人民政府同意改名为 “孝感专署农业试验站”。１９５９年 ７月，更名为 “农业科学研究所”。１９４９－１９６３年，农科所以培育繁殖农作物新品种、研究实验示范推广先进栽培技术为主，同时承担省级区试和地方品种的征集、评选、整理工作。先后鉴定推广小麦、油菜、水稻、棉花等农作物新品种３０多个，改进栽培技术 １０多项，主办高产示范样板 ５个，征集地方品种资源 ３００余份。１９７８年初，孝感地区行署决定将农科所迁到孝感县朱湖农场部队农场。实验基地 ３５２．７亩。这一时期，该所制定研究课题 １８项，取得科研成果９项；鉴定、推广各类农作物良种 ６０多个；主办高产示范样板９个；培训农业技术人员 １７０人。１９７１年农科所作为湖北省的先进典型，在农业部召开的农业科技大会上作先进经验介绍。１９７８年被省科技大会授予先进单位。１９８７年 １２月，农科所迁至位于孝感城关西门外光明村的孝感高中校办农场，实验基地减至４２亩，科研内容以承担省级区试为主。１９９３年 ６月，更名为 “孝感市农业科技研究所”，１９９５年底，农科所升为副县级事业单位。１９％年 １月，鉴于农科所实验基地面积较小，不利于开展科研工作，孝感市委、市政府决定将农科所迁到云梦县伍洛镇镇办农场，时有实验面积 １８８亩。２００１年以来，农作物新品种选育工作相继恢复，取得科研成果 １２项。

三、孝感市亚光医用电子技术研究所

该所成立于 １９９３年，是集医用电子设备研究、开发、推广、应用于一体、具有独立法人资格的民营科技型企业，法人代表孟广寿。办公实验场地在孝感城区东门内正街市卫校院内。该所职工５１人，其中高级职称 １６人，中级职称 １４人。专门从事研究与开发人员 ６人。该所自１９９３年到 ２００５年底，成功研制出的系列高新科技产品有ＺＴ－１２型生物自动脱水机、ＹＴ型生物组织摊烤机、ＹＢ型生物组织包埋机、ＹＧＱ型切片机、ＹＴＧ生物组织处理多用机、ＹＰＳ系列真彩色图像分析系统等。其中，ＺＴ－１２型生物组织 自动脱水机，于 １９９４年通过省级专家鉴定为国内同类产品领先水平。１９％年 ７月获湖北省科技进步一等奖。１９９７年 １２月荣获国家科技进步三等奖。２００２年 １２月被省科技厅认定为高新企业。２００３年６月，该所改制为有限责任公司。２００４年 １１月，通过ＩＳＯ９００１质量管理认证。该所不断加大研发力度，对原有产品不断创新、改进，研制出２５缸式染色机、分体式冷包埋机和ＹＰＳ－２０００彩色病理图文分析系统。至２００５年底，高新技术产品产值 ８００．５９万元，产品销售收人６５９．８２万元。